Tabela aminokislin:
Okrajšava | Ime aminokisline | Lastnost stranske verige | Masa | Izoelektrična točka |
pK1
(α-COOH) |
pK2
(α-+NH3) | pKr (R) | Opombe | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
A | Ala | alanin | hidrofobna | 89.09 | 6.01 | 2.35 | 9.87 | Zelo razširjena aminokislina. Bolj toga od glicina. Majhna molekula, ki izkazuje v beljakovinski strukturi le majhne sterične ovire. Alanin je nevtralna aminokislina. Nahajamo ga tako v hidrofilnih kot v hidrofobnih regijah beljakovin. | |
C | Cys | cistein | hidrofobna | 121.16 | 5.05 | 1.92 | 10.70 | 8.18 | V oksidirajočih pogojih se 2 molekuli cisteina združita preko disuldidnega mostu (-S-S-) in tvorita aminokislino cistin. Če je v beljakovini prisoten cistin, le-ta poveča obstojnost terciarne strukture beljakovine in takšna beljakovina je manj občutljiva na denaturacijo (na primer insulin). |
D | Asp | asparaginska kislina | kisla | 133.10 | 2.85 | 1.99 | 9.90 | 3.90 | Izkazuje podobne lastnosti kot glutaminska kislina. Stranska veriga je hidrofilna z izrazitim negativnim nabojem. Navadno se nahaja na zunanjih hidrofilnih površinah beljakovin. Na negativni naboj v stranski verigi se pogosto vežejo kovinski kationi. |
E | Glu | glutaminska kislina | kisla | 147.13 | 3.15 | 2.10 | 9.47 | 4.07 | Podobne lastnosti kot asparaginska kislina. Ima daljšo, nekoliko bolj gibljivo stransko verigo. |
F | Phe | fenilalanin | hidrofobna | 165.19 | 5.49 | 2.20 | 9.31 | Za ljudi esencialna aminokislina. Fenilalanin vsebuje tako kot tirozin in triptofan veliko togo aromatsko skupino v stranski verigi. Naštete aminokisline so med največjimi. Poleg izolevcina, levcina in valina so hidrofobne aminokisline in se običajno nahajajo v notranjosti beljakovin. | |
G | Gly | glicin | hidrofobna | 75.07 | 6.06 | 2.35 | 9.78 | Zaradi dveh vodikovih atomov na α-ogljiku glicin ni optično aktiven. Glicin je najmanjša aminokislina, ki zlahka rotira in je zelo fleksibilna. Vrine se lahko v zelo majhne prostore, na primer med trojno vijačnico kolagena. Kot strukturna prvina beljakovin se zaradi prevelike fleksibilnosti pojavlja redkeje kot alanin. | |
H | His | histidin | bazična | 155.16 | 7.60 | 1.80 | 9.33 | 6.04 | Protoniranje aminske skupine nastopi tudi v šibko kislem okolju. Histidin je prisoten v številnih beljakovinah, kjer spremeni konformacijo in lastnosti beljakovine. |
I | Ile | izolevcin | hidrofobna | 131.17 | 6.05 | 2.32 | 9.76 | Za človeka esencialna aminokislina. Izolevcin, levcin in valin imajo relativno velike alifatske hidrofobne stranske verige. Te molekule so toge. Za pravilno zvitje proteinov so pomembne hidrofobne interakcije, ki se vzpostavljajo med stranskimi verigami teh aminokislin. Prisotne so zlasti v notranjosti beljakovin. | |
K | Lys | lizin | bazična | 146.19 | 9.60 | 2.16 | 9.06 | 10.54 | Za človeka esencialna aminokislina. Ima podobne lastnosti kot arginin. Poseduje dolgo fleksibilno stransko verigo s pozitivno nabitim koncem. Lizin in arginin sta zaradi svoje fleksibilnosti pripravni aminokislini za vezavo na molekule z negativnim nabojem. Zaradi močnega naboja sta lizin in arginin predvsem na zunanji površini beljakovin. |
L | Leu | levcin | hidrofobna | 131.17 | 6.01 | 2.33 | 9.74 | Za človeka esencialna aminokislina. Ima podobne lastnosti kot izolevcin in valin. Glej izolevcin. | |
M | Met | metionin | hidrofobna | 149.21 | 5.74 | 2.13 | 9.28 | Za človeka esencialna aminokislina. Vedno prva aminokislina, ki se vgradi v beljakovino; po translaciji se nato včasih odstrani. Kot cistein tudi metionin vsebuje žveplo, vendar ima vezano še metilno skupino. Ta metilna skupina se lahko aktivira in zato je metionin vključen v številne reakcije, pri katerih se dodaja nov ogljikov atom. | |
N | Asn | asparagin | hidrofilna | 132.12 | 5.41 | 2.14 | 8.72 | Nevtralizirana inačiva asparaginske kisline.. | |
P | Pro | prolin | hidrofobna | 115.13 | 6.30 | 1.95 | 10.64 | Vsebuje za aminokisline neobičajen cikel, ki vsebuje α-aminsko skupino v obliki amidne skupine (CO-NH). Če je prisotna v peptidnem zaporedju, povzroči obrat peptidne verige in tako prekinja sekundarne strukture beljakovine (α-vijačnica, β-list). Prisoten je v kolagenu, kjer se posttranslacijsko spremeni v hidroksiprolin. | |
Q | Gln | glutamin | hidrofilna | 146.15 | 5.65 | 2.17 | 9.13 | Nevtralizirana inačica glutaminske kisline. V beljakovinah predstavlja zalogo amonijaka. | |
R | Arg | arginin | bazična | 174.20 | 10.76 | 1.82 | 8.99 | 12.48 | Funkcionalno podoben lizinu. |
S | Ser | serin | hidrofilna | 105.09 | 5.68 | 2.19 | 9.21 | Serin in treonin imata kratko stransko verigo, ki se konča s hidroksilno skupino. Vodik iz hidroksilne skupine se zlahka odstrani, zato serin in treonin pogosto nastopata kot donorja vodika v encimih. Oba sta zelo hidrofilna, zato so predvsem zunanje površine beljakovin bogate s tema aminokislinama. | |
T | Thr | treonin | hidrofilna | 119.12 | 5.60 | 2.09 | 9.10 | Za človeka esencialna aminokislina. Ima podobne lastnosti kot serin. | |
V | Val | valin | hidrofilna | 117.15 | 6.00 | 2.39 | 9.74 | Za človeka esencialna aminokislina. Izkazuje podobne lastnosti kot izolevcin in levcin. Glej izolevcin. | |
W | Trp | triptofan | hidrofilna | 204.23 | 5.89 | 2.46 | 9.41 | Za človeka esencialna aminokislina. Ima podobne lastnosti kot fenilalanin in tirozin. Je prekurzor serotonina. | |
Y | Tyr | tirozin | hidrofobna | 181.19 | 5.64 | 2.20 | 9.21 | 10.46 | Ima podobne lastnosti kot triptofan ali fenilalanin. Je prekurzor melanina, adrenalina in ščitničnih hormonov. |